MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 82243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014006	CATC	2	8	162	169	25 %	25 %	0 %	50 %	294009987
2	NC_014006	GGC	2	6	219	224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009987
3	NC_014006	CAT	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294009987
4	NC_014006	GGA	2	6	306	311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009987
5	NC_014006	CGC	2	6	315	320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
6	NC_014006	ACC	2	6	353	358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294009987
7	NC_014006	GGC	3	9	365	373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009987
8	NC_014006	CGC	2	6	411	416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
9	NC_014006	GAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009987
10	NC_014006	GAG	2	6	574	579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009987
11	NC_014006	GGCG	2	8	594	601	0 %	0 %	75 %	25 %	294009987
12	NC_014006	ATCT	2	8	631	638	25 %	50 %	0 %	25 %	294009987
13	NC_014006	CGC	4	12	686	697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
14	NC_014006	TGG	3	9	725	733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294009987
15	NC_014006	CCG	2	6	768	773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
16	NC_014006	AGG	2	6	836	841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009987
17	NC_014006	CGCC	2	8	852	859	0 %	0 %	25 %	75 %	294009987
18	NC_014006	TGGC	2	8	876	883	0 %	25 %	50 %	25 %	294009987
19	NC_014006	CGC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
20	NC_014006	GCG	2	6	919	924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009987
21	NC_014006	GCC	2	6	925	930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009987
22	NC_014006	ATC	2	6	931	936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294009987
23	NC_014006	GCC	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009988
24	NC_014006	GCT	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009988
25	NC_014006	GCG	2	6	1028	1033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009988
26	NC_014006	CGA	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009988
27	NC_014006	GC	3	6	1093	1098	0 %	0 %	50 %	50 %	294009988
28	NC_014006	GC	3	6	1176	1181	0 %	0 %	50 %	50 %	294009988
29	NC_014006	GAC	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009988
30	NC_014006	GCT	2	6	1273	1278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009988
31	NC_014006	CGGG	2	8	1282	1289	0 %	0 %	75 %	25 %	294009988
32	NC_014006	CAT	2	6	1292	1297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294009988
33	NC_014006	GCG	2	6	1307	1312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009988
34	NC_014006	GGC	2	6	1341	1346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009988
35	NC_014006	GCT	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009988
36	NC_014006	GC	3	6	1467	1472	0 %	0 %	50 %	50 %	294009988
37	NC_014006	GCT	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009988
38	NC_014006	CGATC	2	10	1605	1614	20 %	20 %	20 %	40 %	294009989
39	NC_014006	CGC	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009989
40	NC_014006	CTGG	2	8	1647	1654	0 %	25 %	50 %	25 %	294009989
41	NC_014006	GCC	2	6	1711	1716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009989
42	NC_014006	CGG	2	6	1729	1734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009989
43	NC_014006	CTGG	2	8	1746	1753	0 %	25 %	50 %	25 %	294009989
44	NC_014006	CGA	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009989
45	NC_014006	CGGG	2	8	1808	1815	0 %	0 %	75 %	25 %	294009989
46	NC_014006	CGGG	2	8	1859	1866	0 %	0 %	75 %	25 %	294009989
47	NC_014006	GCGG	2	8	1891	1898	0 %	0 %	75 %	25 %	294009989
48	NC_014006	TCC	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294009989
49	NC_014006	GCT	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009989
50	NC_014006	GCGG	2	8	1957	1964	0 %	0 %	75 %	25 %	294009989
51	NC_014006	CGCGG	2	10	1965	1974	0 %	0 %	60 %	40 %	294009989
52	NC_014006	GCG	2	6	2035	2040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009989
53	NC_014006	GCT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009989
54	NC_014006	CG	3	6	2062	2067	0 %	0 %	50 %	50 %	294009989
55	NC_014006	GCTC	2	8	2135	2142	0 %	25 %	25 %	50 %	294009989
56	NC_014006	GACCTT	2	12	2167	2178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294009989
57	NC_014006	GGC	2	6	2247	2252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009989
58	NC_014006	GC	3	6	2251	2256	0 %	0 %	50 %	50 %	294009989
59	NC_014006	GGC	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009989
60	NC_014006	TCT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294009989
61	NC_014006	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	294009989
62	NC_014006	GC	3	6	2367	2372	0 %	0 %	50 %	50 %	294009989
63	NC_014006	CTG	2	6	2374	2379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009989
64	NC_014006	GCC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009989
65	NC_014006	CCG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009990
66	NC_014006	GCG	2	6	2473	2478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009990
67	NC_014006	CGATGC	2	12	2497	2508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294009990
68	NC_014006	GCG	2	6	2535	2540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009990
69	NC_014006	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009990
70	NC_014006	GC	3	6	2561	2566	0 %	0 %	50 %	50 %	294009990
71	NC_014006	ACG	2	6	2576	2581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009990
72	NC_014006	GCG	2	6	2615	2620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009990
73	NC_014006	GCA	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009990
74	NC_014006	GTG	2	6	2726	2731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294009990
75	NC_014006	GCT	2	6	2743	2748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009990
76	NC_014006	GGCG	2	8	2776	2783	0 %	0 %	75 %	25 %	294009990
77	NC_014006	TCG	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009990
78	NC_014006	AGC	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009990
79	NC_014006	GGCCC	2	10	2830	2839	0 %	0 %	40 %	60 %	294009990
80	NC_014006	CCG	2	6	2860	2865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009990
81	NC_014006	GCG	3	9	2899	2907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009990
82	NC_014006	ATC	2	6	2918	2923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294009990
83	NC_014006	GAC	2	6	2932	2937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009990
84	NC_014006	CCG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009990
85	NC_014006	ACG	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009991
86	NC_014006	TTA	2	6	3158	3163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294009991
87	NC_014006	GCCG	2	8	3182	3189	0 %	0 %	50 %	50 %	294009991
88	NC_014006	CGG	2	6	3190	3195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009991
89	NC_014006	GGA	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009991
90	NC_014006	GGA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009991
91	NC_014006	GC	3	6	3306	3311	0 %	0 %	50 %	50 %	294009991
92	NC_014006	GAT	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294009991
93	NC_014006	GC	3	6	3487	3492	0 %	0 %	50 %	50 %	294009991
94	NC_014006	CGG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009991
95	NC_014006	AGG	2	6	3568	3573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009991
96	NC_014006	GCG	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009991
97	NC_014006	CG	4	8	3635	3642	0 %	0 %	50 %	50 %	294009991
98	NC_014006	GGA	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009991
99	NC_014006	TCG	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009991
100	NC_014006	GAG	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009991
101	NC_014006	AGC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009992
102	NC_014006	CG	3	6	3923	3928	0 %	0 %	50 %	50 %	294009992
103	NC_014006	CCGG	2	8	3949	3956	0 %	0 %	50 %	50 %	294009992
104	NC_014006	AGG	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009992
105	NC_014006	GGC	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009992
106	NC_014006	CCG	2	6	4099	4104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009992
107	NC_014006	GCC	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009992
108	NC_014006	GAG	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009992
109	NC_014006	GAG	2	6	4217	4222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009992
110	NC_014006	TGA	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294009992
111	NC_014006	TGT	2	6	4329	4334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294009992
112	NC_014006	ACA	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294009992
113	NC_014006	GCCTG	2	10	4410	4419	0 %	20 %	40 %	40 %	294009992
114	NC_014006	CGGCT	2	10	4521	4530	0 %	20 %	40 %	40 %	294009993
115	NC_014006	TCG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009993
116	NC_014006	AAG	2	6	4604	4609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294009993
117	NC_014006	GTT	2	6	4612	4617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294009993
118	NC_014006	GCTG	2	8	4633	4640	0 %	25 %	50 %	25 %	294009993
119	NC_014006	TGG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294009993
120	NC_014006	GCT	2	6	4681	4686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009993
121	NC_014006	GGC	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009993
122	NC_014006	GCG	2	6	4770	4775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009993
123	NC_014006	GTC	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009993
124	NC_014006	GGT	2	6	4795	4800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294009993
125	NC_014006	CTC	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294009993
126	NC_014006	CGAT	2	8	4857	4864	25 %	25 %	25 %	25 %	294009993
127	NC_014006	CGA	2	6	4915	4920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294009993
128	NC_014006	GCG	2	6	4941	4946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009993
129	NC_014006	CGG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009993
130	NC_014006	GCC	2	6	5019	5024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009994
131	NC_014006	GAG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009994
132	NC_014006	TC	3	6	5070	5075	0 %	50 %	0 %	50 %	294009994
133	NC_014006	GAA	2	6	5127	5132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294009994
134	NC_014006	ATC	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294009994
135	NC_014006	CGG	2	6	5179	5184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009994
136	NC_014006	GCACG	2	10	5192	5201	20 %	0 %	40 %	40 %	294009994
137	NC_014006	CGC	2	6	5237	5242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009994
138	NC_014006	CTG	2	6	5268	5273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009994
139	NC_014006	CTG	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009994
140	NC_014006	CCCG	2	8	5299	5306	0 %	0 %	25 %	75 %	294009994
141	NC_014006	CGGGC	2	10	5309	5318	0 %	0 %	60 %	40 %	294009994
142	NC_014006	GGC	2	6	5353	5358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009994
143	NC_014006	AGCC	2	8	5375	5382	25 %	0 %	25 %	50 %	294009994
144	NC_014006	GAG	2	6	5400	5405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009994
145	NC_014006	CGGCAC	2	12	5414	5425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294009994
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148	NC_014006	GC	3	6	5516	5521	0 %	0 %	50 %	50 %	294009995
149	NC_014006	CGC	2	6	5527	5532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009995
150	NC_014006	CGG	2	6	5540	5545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294009995
151	NC_014006	GCGG	2	8	5656	5663	0 %	0 %	75 %	25 %	294009995
152	NC_014006	AGG	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009995
153	NC_014006	CGC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009995
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156	NC_014006	CCGG	2	8	6139	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	294009996
157	NC_014006	CCG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009996
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159	NC_014006	CG	3	6	6176	6181	0 %	0 %	50 %	50 %	294009996
160	NC_014006	CGC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009996
161	NC_014006	TGG	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294009996
162	NC_014006	GC	3	6	6263	6268	0 %	0 %	50 %	50 %	294009996
163	NC_014006	TCGC	2	8	6356	6363	0 %	25 %	25 %	50 %	294009996
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166	NC_014006	GGA	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294009996
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168	NC_014006	GC	3	6	6571	6576	0 %	0 %	50 %	50 %	294009996
169	NC_014006	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294009996
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175	NC_014006	GC	3	6	6877	6882	0 %	0 %	50 %	50 %	294009997
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179	NC_014006	TCG	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294009997
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266	NC_014006	AAT	2	6	10797	10802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010000
267	NC_014006	TGA	2	6	10860	10865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010000
268	NC_014006	TGA	2	6	10869	10874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010000
269	NC_014006	CGG	2	6	10878	10883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010000
270	NC_014006	GCA	2	6	10920	10925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010000
271	NC_014006	GC	3	6	11056	11061	0 %	0 %	50 %	50 %	294010000
272	NC_014006	GGA	2	6	11086	11091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010000
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274	NC_014006	GC	3	6	11121	11126	0 %	0 %	50 %	50 %	294010000
275	NC_014006	TGTC	2	8	11130	11137	0 %	50 %	25 %	25 %	294010000
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390	NC_014006	CGCC	2	8	16933	16940	0 %	0 %	25 %	75 %	294010004
391	NC_014006	ACA	2	6	16952	16957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010004
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393	NC_014006	GGC	2	6	17059	17064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010004
394	NC_014006	TGC	3	9	17150	17158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010004
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